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Nantes métropole est membre fondateur de l'Institut d'études avancées.
Depuis l'origine, la métropole nantaise soutient le projet de l'Institut par des financements, la mise à disposition des locaux. Jean-Marc Ayrault, puis Johanna Rolland, successivement maires de Nantes, président la Fondation Institut d'études avancées.
Nantes métropole soutient également différents projets déployés à l'Institut tels que la Chaire Arts, sociétés et mutations contemporaines et le projet Vers une internationale des rivières.